Avant l'accident
Boone Carlyle occupe le poste de chef d'une entreprise qui organise des mariages. Cette entreprise est en fait une filiale de l'empire de sa mère. Il a été promu à ce poste peu après la mort de son beau-père. Boone est follement attiré par sa belle-soeur, Shannon, et développe une attraction amoureuse à son égard. Quand il apprend que la jeune femme a de gros problèmes financiers suite au décès de son père, il lui propose de l'argent mais elle refuse (2#06 Abandonnée). Boone sort plusieurs fois Shannon des griffes de ses petits amis abusifs en payant ces derniers pour qu'ils partent. Une nouvelle manoeuvre de ce genre mène Boone à Sydney, où il apprend que Shannon a en fait monté un plan pour obtenir son argent et son attention. Le jeune homme est profondément blessé par cette attitude mais Shannon parvient à se faire pardonner. Ils couchent ensemble avant de repartir aux Etats-Unis (1#13 Le coeur a ses raisons...).
Dans l'épisode 1#19 Tombé du ciel, Boone mentionne le fait que dans son enfance il a eu une nourrice, appelée Theresa, sur qui il passait ses frustrations concernant l'absence de sa mère. Un jour, Theresa est tombée dans les escaliers et s'est cassée le cou en voulant répondre aux nombreuses sollicitations du petit garçon de six ans.
Après l'accident
Après l'accident, Boone se porte volontaire pour se joindre au groupe qui va tenter d'envoyer un appel de détresse par radio (1#02 Le réveil). Par la suite, il tente, sans succès, de sauver une survivante de la noyade. Il est également accusé de vol lorsqu'il amène une bouteille d'eau à Claire alors que le stock du groupe a été volé (1#05 A la recherche du père). Il fait également parti de ceux qui creusent quand Jack se retrouve coincé sous un éboulement (1#07 Le papillon de nuit). Boone est quelqu'un de très serviable et il a une attitude très protectrice avec Shannon (bien qu'il critique souvent son oisiveté). Lorsque cette dernière se rapproche de Sayid, il se met à éprouver de la jalousie et tente à plusieurs reprises d'étouffer cet amour naissant. Boone part souvent à la chasse avec Locke et devient vite son protégé, ce qui les éloigne quelque peu des autres survivants. Lorsque Claire et Charlie se font enlever, les deux compères partent à leur recherche et découvrent une trappe métallique (1#11 Les démons intérieurs). Ils tentent par tous les moyens de l'ouvrir et ne parlent pas de son existence aux autres naufragés. Locke drogue volontairement Boone afin qu'il ait des hallucinations.
Durant cette expérience, il parvient à répondre aux nombreuses questions qu'il se pose au sujet de Shannon et se défait de l'attirance qu'il éprouvait à son égard (1#13 Le coeur a ses raisons...). Dans l'épisode 1#19 Tombé du ciel, Boone et Locke trouvent un petit avion pendu dans les arbres. Il est rempli de statuettes de la Vierge qui renferment de l'héroïne. Boone escalade une falaise pour pouvoir y accéder et découvre une radio en état de marche dans le cockpit de l'appareil. Il tente immédiatement de transmettre un message et reçoit une réponse d'un homme. Plus tard, nous découvrirons que cet homme n'est autre que Bernard, le mari de Rose (Les autres 48 jours). Soudain, l'avion semble ne plus être tenu par les arbres et il s'écrase au sol. Boone est très gravement blessé et, en dépit des tentatives de Jack pour le sauver, il finit par mourir. Ses derniers mots sont "Dites à Shannon..." mais il décède avant d'avoir fini sa phrase. Boone est enterré dans l'épisode 1#21 Elle ou lui. Sayid parle à son enterrement mais pas Shannon. Dans le 3#03, Locke est victime d'hallucinations dans lesquelles Boone le pousse dans son fauteuil roulant à l'aéroport de Sydney. Les autres survivants sont également présents mais il les voit différemment. Boone dit à Locke qu'il doit aider une personne et qu'il est le seul à pouvoir le faire. Plus tard, il réapparaît ensanglanté et mutilé comme avant sa mort. Il dit que Locke doit réparer ses erreurs.